HRK (белок)

Активатор апоптоза harakiri
Доступные структуры
PDBHuman UniProt search: PDBe RCSB
Идентификаторы
Символы HRK, DP5, HARAKIRI, harakiri, BCL2 interacting protein
Внешние IDs OMIM: 603447 HomoloGene: 136405 GeneCards: 8739
Профиль экспрессии РНК
PBB GE HRK 206864 s at fs.png

PBB GE HRK 206865 at fs.png
Больше информации
Ортологи
Виды Человек Мышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003806

n/a

RefSeq (белок)

NP_003797

n/a

Локус (UCSC) Chr 12: 116.86 – 116.88 Mb n/a
Поиск PubMed [1] n/a
Викиданные
Просмотр/Править (Человек)

Активатор апоптоза harakiri (HRK) — белок семейства Bcl2, активатор апоптоза, который у человека ируется геном HRK.


Структура гена, мРНК и белка[ | ]

кДНК HRK была впервые независимо клонирована из клеток HeLa и симпатических нейронов крыс в 1997 году[1][2]. кДНК HRK человека имела длину около 700 нуклеотидов и включала 5'- и 3'-неирующие области, ирующую область и поли(А)-хвост. В 3'-неирующей области был обнаружен сигнал дестабилизации мРНК 5'-ATTTA-3'[1].

Ген HRK ирует белок длиной в 91 аминокислотный остаток. Гомологи HRK по первичной структуре пока не обнаружены. Фрагмент 37—44 гомологичен домену BH3 (англ. Bcl-2 homology domain 3)[1].

Распространение и внутриклеточная локализация[ | ]

Методом нозерн-блота мРНК HRK была обнаружена в лимфоидных органах, особенно в селезёнке и костном мозге, а также в поджелудочной железе человека[1]. Хотя методом полногеномного секвенирования РНК присутствие мРНК HRK в селезёнке и костном мозге выявить не удалось, небольшие её количества были обнаружены в лимфатических узлах, коре головного мозга, щитовидной железе, надпочечниках и тестикулах[3].

мРНК HRK была обнаружена только в головном мозге взрослых крыс и отсутствовала в селезёнке, тимусе, тестикулах, тонком кишечнике, сердечной и скелетных мышцах[2].

Методом иммуногистохимии низкие и средние количества белка Hrk были обнаружены во многих органах, при этом препараты тонкого кишечника, поджелудочной железы, кожи, молочных желёз и лимфоидных тканей имели, как правило, отрицательную окраску (белок отсутствует)[3].

В клетках HRK локализуется преимущественно в митохондриях и взаимодействует там с белком митохондриального матрикса p32[4].

Примечания[ | ]

  1. 1 2 3 4 Inohara N., Ding L., Chen S., Núñez G. harakiri, a novel regulator of cell death, encodes a protein that activates apoptosis and interacts selectively with survival-promoting proteins Bcl-2 and Bcl-X(L) // EMBO J. — 1997. — Vol. 16, № 7. — P. 1686—94. — PMID 9130713.
  2. 1 2 Imaizumi K., Tsuda M., Imai Y., Wanaka A., Takagi T., Tohyama M. Molecular cloning of a novel polypeptide, DP5, induced during programmed neuronal death // J Biol Chem. — 1997. — Vol. 272, № 30. — P. 18842—8. — PMID 9228060.
  3. 1 2 HRK в базе данных The Human Protein Atlas. Дата обращения 7 апреля 2014.
  4. Sunayama J., Ando Y., Itoh N., Tomiyama A., Sakurada K., Sugiyama A., Kang D., Tashiro F., Gotoh Y., Kuchino Y., Kitanaka C. Physical and functional interaction between BH3-only protein Hrk and mitochondrial pore-forming protein p32 // Cell Death Differ. — 2004. — Vol. 11, № 7. — P. 771—81. — PMID 15031724.